Ben Spies uzeo svoju prvu MotoGP startnu poziciju na domaćoj stazi u Indianapolisu. Na drugom mjestu je završio Jorge Lorenzo a treće mjesto je zauzeo još jedan Amerikanac Nicky Hayden.
Svjetski prvak Valentino Rossi doživio je pad šest minuta prije isteka kvalifikacionog vremena. Casey Stoner je bio najbrži u oba treninga, ali je na kraju završio šesti šesti - odmah iza Repsol Honda vozača Andrea Doviziosoa i Dani Pedrose.
1 Ben Spies (Yamaha Tech 3) 1:40.105
2 Jorge Lorenzo (Yamaha Factory) +00.220
3 Nicky Hayden (Ducati MotoGP) +00.231
4 Andrea Dovizioso (Honda HRC) +00.454
5 Dani Pedrosa (Honda HRC) +00.532
6 Casey Stoner (Ducati MotoGP) +00.559
7 Valentino Rossi (Yamaha Factory) +00.900
8 Marco Simoncelli (Honda Gresini) +00.987
9 Colin Edwards (Yamaha Tech 3) +01.127
10 Loris Capirossi (Suzuki MotoGP) +01.407
11 Alvaro Bautista (Suzuki MotoGP) +01.429
12 Marco Melandri (Honda Gresini) +01.518
13 Hiroshi Aoyama (Honda Interwetten) +01.526
14 Aleix Espargaro (Ducati Pramac) +01.544
15 Mika Kallio (Ducati Pramac) +01.751
16 Hector Barbera (Ducati Aspar) +01.791
17 Randy de Puniet (Honda LCR) +01.818